地圖龜的龜甲較扁平，但中央脊棱隆起較高，使龜背看起來有些成屋頂的形狀，無側棱。幼體時龜甲近圓形，長大后略長。中央脊棱處，每塊椎盾后沿都向后突出，呈棘刺狀，尤以第二與第三椎盾上的最為尖長，第五板則幾乎沒有突起。
地圖龜的頸盾呈梯形，緣盾在龜甲前方與側方微呈鋸齒狀，但自第七枚直至臀盾，則呈強鋸齒狀。從第九枚緣盾到臀盾，每枚都有兩個突起的盾尖，這一特征幼體明顯，成體略可見。腹甲平，喉盾前沿平，兩肛盾間缺刻淺，使腹甲略成長方形。
地圖龜的四肢扁平，具發(fā)達的蹼，前肢外側具一排大的緣鱗。尾巴中等長。地圖龜的顏色較巴西龜與彩龜類顯得素雅一些。背甲通常為灰色調，并帶有橄欖色或綠色，因個體間差異可深或淺，深者近灰褐色，淺者灰黃色。幼龜體色淺淡，成體加深。整個背甲上，每塊盾片上都有棕黃色至土黃色的細線紋，并鑲以棕色邊沿，這些線紋彎曲交錯，形成網目狀圖案，又頗似地圖等高線，故名圖龜。但并不十分鮮明。中央脊棱貫穿前后形成一條黑線，長大后逐漸斷續(xù)，僅棘刺先端為黑色。腹甲淡黃色，緣盾下方也為淡黃色，具棕黑色或灰黑色的旋渦狀環(huán)紋，斑紋彎曲重疊，相當密。
地圖龜的甲橋上亦具斑紋。緣盾下方具同心圓環(huán)紋。頭、肢、尾灰色至橄欖褐色，腹面色淡，基部黃色，其上布滿具黑邊的黃色條紋，就如同巴西龜的一樣，但較細密。頭部較鈍，上喙中央微凹，角質喙緣突出。
地圖龜的頭頂光滑，灰黑色；自吻端至頭頂后方，中央有一黃紋，其兩側各有一黃色斜紋，在枕部形成類似“V”字形圖案，但兩紋并不相交，而是沿頸背一直向后延伸，逐漸暗淡，隱沒于底色中。另有數條斑紋在頸背與其平行排列。“V”字兩支叉在眼后方分別向頭頂外側拐，如在“V”字兩又頂部分別加了一“橫”。與這兩“橫”平行，亦有幾條小紋。
地圖龜頭頂的“V”字紋為圖龜類的標志，種與種之間雖有不同，變化也極大，但都可看出是如何變化而來的。依此圖紋形狀可對不同種類加以區(qū)分。除上述圖紋外，頸側與腹面也都有黃色的條紋，至頸基則彎曲盤繞，不再平行。眼前下方與喉部，斑紋呈黃色的小圓環(huán)狀。通常喉下有3-5個。尾背有黃色“Y”字形紋。地圖龜眼的虹膜一般呈白色，無貫穿瞳孔的黑色橫線，但亦有棕黃色虹膜與有橫線的個體。
